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xiaomifeng 2020-7-25
“特朗普欠我们一个道歉。”这是石正丽的主张。
7月24日，《科学》发表了对中科院武汉病毒所研究员石正丽的专访，也以“特朗普欠我们一个道歉“为标题。石正丽，这位蝙蝠冠状病毒研究专家在疫情发生以来一直处在舆情旋涡中心。美国总统特朗普更是宣称，正是新冠病毒从她的实验室逃逸出来才导致的人类大流行。
图 | “特朗普欠我们一个道歉”（来源：Science）
石正丽一直对这些质疑没有正式发声。直到7月15日，她通过电子邮件回答了《科学》杂志提出的18个问题。在这些答复中，她反驳了新冠病毒自其实验室逃逸的说法，称在疫情发生之前，他们从未接触或研究过这种病毒，也不知该病毒的存在。“ 特朗普的说法危害并影响了我们的学术工作和个人生活。他欠我们一个道歉。”
她还指出，其实验室所有员工和学生都接受了新冠病毒检测，均为阴性，这也反驳了其实验室成员感染引发疫情的推测。
对于美国国立卫生研究院（NIH）削减蝙蝠病毒研究支持的决定，石正丽认为这不可理解，且是绝对荒谬的。
看到石正丽对18个问题的回应，美国乔治城大学传染病专家丹尼尔 · 卢西（Daniel Lucey）说，“这里有很多我不知道的事实，直接听到她的消息令人振奋。”
据《科学》报道，这18个问题的解答出台不易，历经了2个月，也经过了中科院新闻工作人员的协调。下文为《科学》杂志采访石正丽的问答原文，经DeepTech翻译。
图 | 2004年，石正丽在广西的一个蝙蝠洞中。（来源：ZHANG SHUYI）
1、问：你发表过许多有关冠状病毒的论文，甚至警告过这些病毒从动物到人传播的可能性。你有没有发现这些警告没有得到重视？与现实中大流行的规模相比，你的预期是怎样的？
石正丽：跨物种感染的风险始终是存在的，中国针对这一问题立了项，建立了相关设施和设备，以及组建了专家团队。随着全球环境变化和人类活动的不断扩展，人类感染的风险也在不断增加，这得到了我们研究的证实。不过，我们的研究并未涉及流行病规模的调查。
2、问：大流行对你个人和职业有何影响？
石正丽：这次大流行让我认识到我们工作的重要性和必要性。我认为，如果能够在疫苗和治疗药物方面进行更多基础研究和技术开发，我们会得到更好的结果。
3、问：关于新冠病毒的起源，你的理论主张是什么？你的研究对这个问题有何启发？
石正丽：根据我们团队和国际同行的研究结果，新冠病毒很可能起源于蝙蝠。它可能已经在一个或多个中间宿主中发生了进化，并适应了人类，最终在人类之间传播开来。不过，我们并不清楚究竟哪些动物是中间宿主，以及这种病毒是如何传给人类的。
4、问：假如病毒在物种间跳跃是自然发生的，你如何看待这种情况的可能性？武汉及其附近的蝙蝠有没有可能感染了某个人呢？如果不在武汉，那么可能在哪里发生？你如何看待矿区附近居民染病后前往武汉的推测？
石正丽：从自然界宿主到人类的跨物种传播有两种途径。其一是病毒由蝙蝠直接传给人类，其二是病毒经由一个或多个中间宿主传播给人类。对于新冠病毒，第一种可能性不能排除，但可能性很低。我倾向于支持第二种可能。
目前尚未科学证实中间宿主是何时、何地传给人类的。以艾滋病为例，大的新兴疾病流行时，其暴发地往往不是起源地，所以追踪病毒起源是一个极具挑战性的科学任务。关于新冠病毒的起源和传播途径的确认，需要开拓性的视野，也需要全球科学家的合作，也需要时间。
我们在湖北省追踪蝙蝠病毒多年，并未在武汉以及湖北省内的蝙蝠中发现与新冠病毒密切相关的冠状病毒。我认为新冠病毒从蝙蝠到人类的跨物种传播并不发生在武汉或湖北。
我想（你的最后一问）是指云南墨江县通关镇的蝙蝠洞。迄今为止，附近居民并未感染新冠病毒，因此，所谓 “零号病人” 在矿区感染然后前往武汉的说法是错误的。
5、问：武汉市华南海鲜市场的早期暴发，让许多人认为是该地某种动物感染了人类。但逐渐发现许多早期感染者与该市场无关，那么你对海鲜市场（在疫情）中的角色怎么看？
石正丽：正如你所言，一些早期患者没有华南海鲜市场暴露史。我们在该市场中的卷门把手、地面和污水等环境样品中检测到了新冠病毒，但在冷冻动物样品中并未检测到。（所以）华南海鲜市场可能只是一个拥挤的场所，在那里发现了许多早期的新冠患者。
6、问：据你所知，是否有检测过华南海鲜市场的动物（样本）？如果没有检测过，为什么不这么做？
石正丽：在湖北省政府的安排下，我的团队和华中农业大学的研究员合作，采集了华南海鲜市场的环境样本和冷冻动物样本。我们只在卷帘门的门把手、地面、下水道这些环境样本中检测到新冠病毒核酸，并没有在动物样本中检测到。
7、问：是否曾经尝试过，利用（华南海鲜）市场的进货登记，来检测给市场供货的上游养殖场？你的团队或者其他团队是否在任何养殖场或野生动物养殖场检测出新冠病毒？如果是，这一系列研究发现了什么？
石正丽：在湖北省政府的安排下，我的团队和华中农业大学的研究员合作，采集了武汉附近以及湖北省其他地方养殖场动物和家畜的样本。我们在这些样本中没有发现新冠病毒核酸。
8、问：你是否亲自检测过来自华南海鲜市场的环境样本或动物样本？如果是，你发现了什么？如果不是，你对来自该市场的样本检测结果有何看法？
石正丽：我们在武汉海鲜市场的环境样本中检测到新冠病毒核酸，包括在卷帘门把手、地面和下水道中，但检测到的病毒基因组拷贝数很低。
9、问：据我所知，最早报告的病例中，有一名与海鲜市场无关的患者，他在12月1日出现感染症状，另一篇新闻报道称11月份已经出现了病例。你知道的最早确诊病例发生在什么时候？病例统计数据如何？
石正丽：我没有参与流行病学调查，所以对此了解不多。我记得我所在的研究所第一次接收到临床样本是在2019年12月30日，样本被标记为“不明原因肺炎”。
10、问：你认为什么地方最有可能发生动物到人的传播？武汉？湖北？还是其他地方？
石正丽：在我们有确凿的证据之前，我不能给出任何结论。追踪病毒的起源是一个科学问题，科学家应该基于可靠的数据和科学证据来回答这个问题。然而，我前面提到的历史经验是值得注意的。
11、问：你曾经报告了一种蝙蝠冠状病毒——RaTG13。很明显，这是新冠病毒的遥远祖先，他们有1100个核苷酸的差异。其他研究人员利用分子时钟估计，RaTG13和新冠病毒至少是在20年前分化的。你自己的推断是什么？你认为在蝙蝠和人类之间有一种中间宿主吗？如果有，你认为最可能是什么动物？为什么？有数据表明穿山甲可能是中间宿主，你怎么看？
石正丽：我不是生物信息学专家，所以我没有估计出 RaTG13和新冠病毒在进化上的关系。我认为，由自然宿主携带的冠状病毒在演变成新冠病毒之前，至少会通过一种中间宿主进行传播。穿山甲冠状病毒与 RaTG13以及新冠病毒的基因序列比较接近，它们可能有共同的祖先。但是根据现有的数据，我不能确定穿山甲是自然宿主还是中间宿主。
12、问：你或你认识的其他人，有和兽医交流过吗？比如某些动物生病可能与新冠病毒有关。
石正丽：从没有。我不知道任何关注这方面问题的信息。
13、问：你的团队对猫进行了一项有趣的研究，研究显示武汉102只流浪猫和家猫中，有15% 体内有新冠病毒抗体。哈尔滨另一个研究小组的研究表明，猫很容易感染并传播病毒。猫可能是在家里被感染的人感染，甚至纽约一家动物园里的大型猫也被感染了。你认为 “猫更容易感染并传播病毒” 可能性有多大？
石正丽：武汉新冠疫情暴发后，我们对采集的猫血清中新冠病毒抗体检测显示，家猫新冠病毒感染率和抗体滴度均高于流浪猫。所以我认为猫身上的新冠病毒感染很可能是通过人类传播的。
14、问：猫可能是介于蝙蝠和人类之间的中间宿主吗？你是否考虑过这种可能性？有人研究过吗？我知道在你研究中，病毒暴发前猫血清没有携带新冠病毒抗体，但那只是一个小样本。你考虑过扩大调查范围吗？
石正丽：需要进行进一步的研究来调查猫是否为新冠病毒的潜在中间宿主。目前我们的实验室没有继续进行关于猫的研究。根据我们实验室和其他团队的发现，病毒可能是由人传给猫的。
15、问：据你所知，哪些中国的实验室正在调查病毒的来源？他们的研究情况如何？你知道为什么涉及新数据的论文发表得如此之少？
石正丽：中国的许多团队正在进行这样的研究。我们正在发表论文和数据，包括关于病毒起源的论文和数据。我们正在通过多种方式从不同方向追踪病毒的来源。
图 | 石正丽团队从野外捕获的蝙蝠中取样。（来源：生态健康联盟）
16、问：武汉病毒研究所被举世关注，因为该所被猜测为新冠病毒的可能来源。唐纳德 · 特朗普总统表示，他非常相信病毒来自实验室。这对你们实验室有什么影响？对你个人有什么影响？
石正丽：我们于2019年12月30日首次收到新冠病毒的临床样本，当时称为病因不明的肺炎样本。随后，我们与国内其他机构进行了快速的、平行的研究，迅速鉴定出病原体。新冠病毒的全基因组序列已于1月12日通过世界卫生组织提交并发表。在此之前，我们从未接触或研究过这种病毒，也不知道它的存在。
来自世界各地的科学家压倒性地得出结论：新冠病毒是自然产生的，而不是来自任何机构。美国总统特朗普声称新冠病毒是从我们研究所泄露的，这完全违背事实。它危害和影响了我们的学术工作和个人生活。他欠我们一个道歉。
17、问：许多分析过新冠病毒序列的科学家得出结论，它不具有实验室人造病毒的特征。但即便如此，某些研究人员也表示存在一种其它可能性：新冠病毒存在于你的实验室，偶然感染了一名实验室工作人员。他们注意到，曾经一些实验室偶然感染并引起 SARS 病毒的传播。所以你怎么能排除这种可能性呢？
石正丽：在过去15年里，我们已经分离出3种与蝙蝠有密切关系的冠状病毒(这里分离出的病毒是一种活病毒，可以在实验室的培养细胞中生长)，它们都是与 SARS 相关的冠状病毒。这些蝙蝠病毒具有79.8% 的序列同一性，与新冠病毒有远亲关系。
2月3日，我们在《自然》杂志上发表了一篇论文，报道了新冠病毒在全基因组水平上与一种名为 RaTG13的蝙蝠冠状病毒 (我想强调的是，我们只掌握了该病毒的基因组序列，并没有分离出该病毒) 具有96.2% 的相似性。冠状病毒大约有3万个核苷酸，比大多数动物 RNA 病毒的基因组更大。基因组序列的3.8% 差异对于冠状病毒来说是一个显著的差异。
3月18日，来自斯克里普斯研究所、哥伦比亚大学、杜兰大学、爱丁堡大学和悉尼大学的5名著名病毒学家在《自然医学》杂志上发表了一篇题为《新冠病毒的近端起源》的论文。作者指出，尽管 RaTG13总体上与新冠病毒有96% 的相同，但它的刺突在受体结合区域不同。
4月23日，美国新闻网站 “VOX” 引用了悉尼大学病毒进化专家爱德华 · 霍姆斯教授的观点。霍姆斯教授说，新冠病毒和 RaTG13之间的基因组序列差异水平需要平均50年 (至少20年) 的进化。蝙蝠携带的 RaTG13和新冠病毒的基因组在1177个核苷酸位置上存在差异。自然进化需要很长时间来积累足够数量的突变。突变发生在1100多个位置与新冠病毒完全相同的概率极小。因此，在自然界中，RaTG13进化为新冠病毒仅在理论上可行。
同时，我所进行的研究和实验严格按照国际和国家对生物安全实验室的管理要求进行，实验活动在所要求的生物安全实验室进行。P3和 P4实验室的设施和管理都非常严格。例如，研究人员必须穿戴个人防护装备；实验室的空气必须经过高效过滤才能排出；废水和固体废物必须在高温高压下消毒；整个实验过程由生物安全管理人员进行视频监控；每年实验室的设施和设备必须由政府授权的第三方机构进行检测，只有通过测试后，实验室才能继续运行 。我们机构的高水平生物安全实验室一直安全、稳定运行。截至目前，未发生病原体泄漏或人员感染事故。
18、问：持怀疑论调的人提出了几种该病毒从武汉病毒研究所泄露的猜想。我想问一些关于你们实验室工作的具体的事实性问题，可以进一步阐明这些情况：
（1）问：研究所是否培养了蝙蝠冠状病毒？
石正丽：我们仅从蝙蝠身上分离出3种活的 SARS 相关冠状病毒菌株（SARSr-CoV），它们与 SARS 病毒具有95-96％的基因组序列相似性，与新冠病毒的相似性不足80％。这些结果分别发表于《自然》、《病毒学杂志》和《PLoS 病原体》。
（2）问：你的团队是否从生物样品中提取出病毒并进行测序？或者这项工作是在其他地方完成的？
石正丽：我们在实验室中从生物样品中分离出了病毒，提取了病毒 RNA（核糖核酸）。测序主要在武汉进行。
（3）问：你的实验室最近是否对 SARS 相关病毒进行了任何动物实验？如果是的，能否提供详细信息？
石正丽：我们于2018年和2019年在研究所的生物安全实验室中对转基因（表达人类 ACE2）小鼠和果子狸进行了活体实验。我们使用的病毒是与 SARS 病毒接近的蝙蝠 SARSr-CoV。此项工作严格遵守中国实验室病原微生物生物安全管理规定进行。结果表明，蝙蝠 SARSr-CoV 可以直接感染果子狸，也可以感染具有人类 ACE2受体的小鼠。不过， 它在小鼠中显示出低致病性，在果子狸中没有致病性。这些数据正在整理并将很快发布。
（4）问：与研究所有关的某人是否有可能以其他方式被感染，例如在收集、采样或处理蝙蝠时？
石正丽：不存在这种可能性。最近，我们对实验室的所有员工和学生进行了血清检测，没有人感染蝙蝠 SARSr-CoV 或新冠病毒。迄今为止，我们研究所的所有员工和学生都是“零感染”。
（5）问：实验室中是否有蝙蝠的生物样本尚未进行病毒检测？如果是这样，你测试了多少样本，还有多少未经测试？如果有未经测试的样本，你如何确定其中没有包含新冠病毒或与之相近的病毒？
石正丽：我们对收集的所有蝙蝠样本进行了测试，包括蝙蝠肛门拭子、口腔拭子和粪便样本，其中有2007份样本呈冠状病毒阳性。 我们没有发现任何病毒的基因序列比 RaTG13更近似于新冠病毒。
（6）问：你的实验室是最早完成（新型冠状）病毒测序和分离的实验室之一。你最早在何时何地开展测序工作的？
石正丽：我们于2019年12月30日收到了来自7名患者的第一批样本。使用能检测所有 SARS 相关冠状病毒的全冠状病毒 RT-PCR 和定量 RT-PCR（方法），我们发现有5名患者的样本呈阳性。12月31日，通过分析 RT-PCR 产物的测序结果后，我们确定它是一种全新的 SARS 相关冠状病毒。然后我们利用不同的方法确认了结果，并且进行了全基因组测序以及病毒分离。我们于1月12日通过 WHO 向全球公布了基因组序列。
（7）问：2013年的墨江山洞（发现了什么）呢？你何时首次分离出 RaTG13？什么时候完成了测序？
石正丽：2013年，我们从云南省墨江县通关镇收集的蝙蝠粪便样本中，通过全冠状病毒 RT-PCR 检测到 RaTG13病毒，并获得了部分 RdRp（RNA 依赖的 RNA 聚合酶）序列。由于该病毒与 SARS 病毒的相似性较低，因此我们对此序列没有特别注意。
2018年，随着我们实验室的 NGS 测序技术和能力的提高，我们使用剩下的样品对其进行了进一步测序，获得了 RaTG13的全基因组序列，除了5'端的15个核苷酸。由于样品被多次用于病毒核酸提取，因此在完成基因组测序后就没有样品了，而且我们也没有对其进行病毒分离和其他研究。在我们收集的所有蝙蝠样品中，仅有一个样品中检测到 RaTG13病毒。
在2020年，我们比较了新冠病毒序列和一些我们尚未发表的蝙蝠冠状病毒序列，发现 RaTG13与前者具有96.2％的相似性。 RaTG13从未被分离或培养过。
（8）问：一些怀疑实验室发生事故的人表示：你在2016年描述的蝙蝠病毒 BtCoV / 4991就是新冠病毒。理由是，发布时，你只公布了一种蛋白质的序列，即 RdRp。基因库 GenBank 上的 BLAST 分析表明，BtCoV / 4991和 RaTG13的 RdRp 是100% 同源的。那么 BtCoV / 4991是否实际上就是 RaTG13，这与你2020年描述如何对只有 RdRp 序列的病毒进行完整测序的研究报告相吻合。如果是这样，为什么还要重命名该病毒？RaTG13中的 “TG” 代表什么？
石正丽：Ra4991是蝙蝠样品 ID，而 RaTG13是样品中检测到的冠状病毒的 ID。我们更改了名字是因为我们想更好地反映出样本的收集时间和位置。 13表示它是在2013年收集的，TG 是通关镇的缩写，即样品收集的地址。
（9）问：为什么有些病毒只有 RdRp 序列而不是完整序列？你测试过的样本中有多少个获得了全序列？有多少个仅有 RdRp？
石正丽：由于资金和人力限制，我们不可能对所有样品进行全基因组测序。我们希望在未来两年内对一些其他样品进行进一步的冠状病毒全基因组测序。但是，对于某些样品，由于其中的病毒核酸含量低，不可能获得完整的病毒基因组序列。
（10）问：（疫情）暴发后你是否曾被指示消灭所有病毒？
石正丽：没有。
（11）武汉的另一个实验室或者武汉市疾病预防控制中心是否可能出现了意外泄露？如果你排除了这种可能性，原因是什么？
石正丽：根据日常的学术交流和讨论，我排除了这种可能性。
（12）问：还有其他我没问到，但你想告诉公众的事情吗？
石正丽：随着世界各地新发传染病的不断出现，科学家开始研究野生动物携带的病毒。这不仅是对来自它们身上的疾病进行预警的关键，还是用于疾病预防的重要科学依据。
在这种情况下，我与美国 EcoHealth Alliance 主席彼得 · 达萨克博士（Dr. Peter Daszak）进行了合作研究。我们在病毒监控和病原体发现领域建立了良好的关系。我们的研究团队在蝙蝠种群中发现了多种具有不同序列的冠状病毒，其中一些具有传播到人类和动物的潜力，例如 SARS 相关冠状病毒，MERS 相关冠状病毒，SADS（猪急性腹泻综合征冠状病毒）相关冠状病毒等等。这些发现为预防和控制传染病提供了重要线索。
我们不理解美国 NIH（为什么）终止了我们合作项目的资金支持，我们认为这绝对是荒谬的。该项目是一项国际合作工作，旨在聚集来自不同国家的科学家，共同探索传染病的早期预警和预测，这将有助于疫苗设计和药物开发，从而保护我们免受冠状病毒的威胁。在过去的20年中，冠状病毒一直在破坏和影响人类的生活和经济。
在这里，我谨呼吁国际社会加强在新兴病毒起源研究方面的国际合作。我希望世界各地的科学家能够携手并肩，共同努力。寻找病毒起源的目的是为了防止再次出现会危害人类社会的类似疫情爆发。只有这样，当疫情出现时，我们才可以更有效地应对。
* 在收到石正丽回复后，《科学》编辑又追加了两个补充问题。
问：你是否进行或参与了未发表的冠状病毒增強功能（gain-of-function）实验？如果有，是否可以提供详细信息？
石正丽：没有。
问：大多数地方的冠状病毒研究都是在 BSL-2或 BSL-3（生物安全等级2或3）实验室进行的，你的武汉病毒研究所直到最近才拥有可运行的 BSL-4，为什么你要在 BSL-4下进行冠状病毒实验？
石正丽：我们实验室的冠状病毒研究是在 BSL-2或 BSL-3实验室进行的。
研究所的 BSL-4实验室投入运行后，根据 BSL-4实验室的管理规定，我们在 BSL-4实验室中使用低致病性冠状病毒作为模型病毒对科研人员进行了培训，旨在为进行高致病性微生物的实验活动做准备。
新冠病毒爆发后，我国规定新冠病毒的培养和动物感染实验应在 BSL-3或以上实验室进行。 由于我们研究所的 BSL-3实验室不具备进行非人类灵长类动物实验的硬件条件，为了进行上述研究，我所向政府机构申请并获得了在武汉 P4实验室进行新冠病毒实验的资格，其中已开展了恒河猴动物模型等研究。实验活动受到我所生物安全委员会的监督，符合生物安全法规。
网易 2020.07.25
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